Докторската програма „Исторически изследвания” на НБУ се стреми да отговори на необходимостта от подготовка на високо специализирани специалисти, които да познават и интерпретират професионално миналото и генезиса на проблемитe, с които се сблъскват България, Европа и света в настоящето. Целта е да бъдат подготвени млади учени, които да работят в областта на българската история от Средновековието до наши дни, балканистиката, османистиката, новата и най-нова история. Повишеният интерес в историографията, медиите и обществото към Източна Европа и Балканите, като част от европейското пространство, изисква задълбочено изучаване, познаване и представяне на историческото наследство на региона като важна част от културното многообразие на европейското минало.